A főszereplő Yamato Delgado, aki rátalál a legendás Kobalt Penge nevű B-Damanra. Ő és barátai a B-Daman sportágat használják, hogy megküzdjenek az Árnyak Szövetségével, akik meg akarják hódítani a világot. A történet B-Da Földön játszódik, egy posztapokaliptikus pusztaságon, ahol emberek, antropomorf állatok és robotok laknak. A legendás B-Daman használatával Yamato benevez a Győztesek Kupájára, hogy B-Da bajnok legyen, eközben pedig az Árnyék Szövetség ellen is harcolnia kell. A torna megnyerése és a szövetség legyőzése után Yamatonak az újonnan alakult Neo Árnyék Szövetséggel kell szembenéznie, hogy legyőzhesse a gonosz Marda B-t.
